Dans cette salle, se déroulent les réunions du Grand Conseil. Les membres décident des missions importantes comme celles de sauvetage ou de batailles contre l'ennemi.
La salle de contrôle abrite le DHD qui contrôle la porte des étoiles. La salle de réunion est l'endroit où les Anciens discutent des missions avant et après les avoir effectués.
L'infirmerie accueille les malades et les blessés après une mission. Il existe trois laboratoires sur la cité d'Atlantis : physique-chimie, biologie et archéologie. Les cellules accueillent les prisonniers ennemis. Le réfectoire est l'endroit idéal pour se remplir l'estomac après une mission et aussi pour discuter avec ses amis.
Les quartiers comprennent tout ce qu'il y a de vital pour un Ancien : lit, armoire, bureau... Le hangar à vaisseaux contiennent les puddle jumper. L'armurerie contient des armes très puissances. La salle d'entraînement est prévu pour s'améliorer dans les compétences militaires telles que le arts martiaux...